本所前身為「臺灣坪林戒治所」，於民國93年1月1日成立，原由國防部移撥國軍新店監獄坪林分監，作為北區獨立戒治所之用，嗣因該地未能通過環評審查，遂於95年1月1日，以易地更名方式，另於國防部已裁撤之新店監獄舊址(即現址新店區莒光路42號)，成立「臺灣新店戒治所」，並於95年4月起正式收容受戒治人。100年1月1日，因法務部矯正署成立，本所改隸而更名為「法務部矯正署新店戒治所」，並於同年10月1日附設觀察勒戒處所。

本所法定容額為1,169人，負責收容臺灣臺北、士林、新北、宜蘭、基隆、桃園、新竹地方檢察署等指揮執行之男性成年受觀察勒戒人及受戒治人，另附設法務部矯正署臺北監獄新店分監收容刑期未滿7年之男性受刑人。